1987年在葡萄牙塞图巴尔胜利青年队开启执教生涯。
1992年至2000年穆里尼奥先后在葡萄牙体育、波尔图、巴塞罗那担任助理教练。
2000年至2002年穆里尼奥先后担任本菲卡、莱利亚主教练。
2002至2012年穆里尼奥先后在波尔图、切尔西、国际米兰、皇家马德里担任主教练。在此期间,穆里尼奥率队夺得2次欧洲冠军联赛冠军,并在葡超、英超、意甲、西甲实现连续150场联赛主场不败,夺得7次顶级联赛冠军。
2013年7月穆里尼奥重返切尔西,随后率队夺得2014-15赛季英超联赛冠军。
2016年7月穆里尼奥出任曼联主教练。
2019年11月穆里尼奥出任热刺主教练。
2021年5月4日,罗马足球俱乐部官方宣布,穆里尼奥成为球队新帅。[44]
导火索应该是队医事件,当时扎球王受伤,场上已经被罚下一人,队医进场后球员就需要离场,那样就会变成9打11,鸟认为无大碍,只是扎借受伤休息下,所以对队医发火。而球迷打出的标语“三只老鼠”也进一步指出了球迷心中的内鬼。只能说,鸟第二赛季拿到的冠军,让球员,高层,鸟都麻痹大意了,球员放假回来身体发福,状态不佳,高层认为既然夺冠无需费力引援,结果整来了300万的吉洛博吉,开赛后又着急麻慌的买来了佩刀。鸟下课有自身的原因,有球员的因素,更有高层那所谓的最己阵。
当年穆尼里奥二次入主切尔西,第一赛季自称小马驹轻松第三名,第二赛季记得很清楚从第一轮坐上榜首的切尔西一直在榜首待到38轮横扫英超夺冠,而德布劳内和萨拉赫在这个人才济济的队伍中都没有主力位置。第三赛季一下子沦落到保级圈边缘,这在穆尼里奥水平是不可能的,究竟发生了什么?主角是阿布亲信格拉诺夫斯卡娅,事件是穆尼里奥卫冕引援名单,一个没来,而来的是早已远离欧洲的帕托,曼联29场进一球的法尔考,现在都不知道干什么的巴巴,吉洛鲍吉,首发数场一个人未过无进球无助攻的意甲过人王夸德拉多。引起穆尼里奥强烈不满,双方矛盾势同水火。导火索是女队医,她是格拉诺夫斯卡娅的一个小棋子,把比赛已经焦头烂额的穆尼里奥告上了法庭。格拉诺夫斯卡娅再指点几个球员,大家都知道她是阿布的什么人,当然听她的安排,于是阿扎尔,米克尔,特里,小法,迭戈科斯塔...最搞笑也最能表演的是前一个赛季英超最佳右后卫号称恐怖伊万,成了切尔西右路走廊,让大家认识了英超十九位左边锋,其中记忆最深的前米兰球员尼昂,名不见经传,但因特殊名字我记得他。一场比赛下来,过伊万数次,这场发挥跟c罗梅西有的一拼。穆尼里奥是实实在在输给了个性,不懂得中国博大精深的中庸之道,倒在了权利之争舞台上,悲剧啊。